MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_3

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011657	CAAAA	2	10	8	17	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011657	A	6	6	14	19	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011657	ATA	2	6	31	36	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011657	TA	3	6	35	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011657	ATA	2	6	79	84	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011657	TGA	2	6	90	95	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011657	ATAG	2	8	160	167	50 %	25 %	25 %	0 %	217322986
8	NC_011657	TAA	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217322986
9	NC_011657	A	7	7	178	184	100 %	0 %	0 %	0 %	217322986
10	NC_011657	CAA	2	6	224	229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217322986
11	NC_011657	A	6	6	263	268	100 %	0 %	0 %	0 %	217322986
12	NC_011657	AAT	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011657	AGA	2	6	334	339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011657	AAT	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011657	TACT	2	8	400	407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_011657	TAA	4	12	426	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011657	CATAT	2	10	501	510	40 %	40 %	0 %	20 %	217322987
18	NC_011657	GTT	2	6	515	520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217322987
19	NC_011657	CTTCC	2	10	563	572	0 %	40 %	0 %	60 %	217322987
20	NC_011657	T	6	6	627	632	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
21	NC_011657	TTG	2	6	636	641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217322987
22	NC_011657	TGTA	2	8	702	709	25 %	50 %	25 %	0 %	217322987
23	NC_011657	TC	5	10	720	729	0 %	50 %	0 %	50 %	217322987
24	NC_011657	TGA	2	6	745	750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	217322987
25	NC_011657	T	6	6	795	800	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
26	NC_011657	CCA	2	6	809	814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	217322987
27	NC_011657	T	6	6	872	877	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
28	NC_011657	TTCG	2	8	891	898	0 %	50 %	25 %	25 %	217322987
29	NC_011657	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217322987
30	NC_011657	T	6	6	954	959	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
31	NC_011657	T	7	7	971	977	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
32	NC_011657	TTGATT	2	12	994	1005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	217322987
33	NC_011657	CTTTTT	2	12	1038	1049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217322987
34	NC_011657	TC	3	6	1083	1088	0 %	50 %	0 %	50 %	217322987
35	NC_011657	TCTTTT	2	12	1093	1104	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	217322987
36	NC_011657	CATC	2	8	1118	1125	25 %	25 %	0 %	50 %	217322987
37	NC_011657	T	7	7	1129	1135	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
38	NC_011657	T	6	6	1159	1164	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
39	NC_011657	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	217322987
40	NC_011657	TGG	2	6	1261	1266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	217322987
41	NC_011657	GTT	2	6	1319	1324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217322987
42	NC_011657	T	6	6	1323	1328	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
43	NC_011657	ACA	2	6	1339	1344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217322987
44	NC_011657	GTT	2	6	1372	1377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217322987
45	NC_011657	T	7	7	1408	1414	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
46	NC_011657	T	6	6	1448	1453	0 %	100 %	0 %	0 %	217322987
47	NC_011657	A	6	6	1455	1460	100 %	0 %	0 %	0 %	217322987
48	NC_011657	GTT	2	6	1466	1471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	217322987
49	NC_011657	GTAAC	2	10	1502	1511	40 %	20 %	20 %	20 %	217322987
50	NC_011657	TCAT	2	8	1573	1580	25 %	50 %	0 %	25 %	217322987
51	NC_011657	CTT	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	217322987
52	NC_011657	C	6	6	1744	1749	0 %	0 %	0 %	100 %	217322987
53	NC_011657	GA	3	6	1778	1783	50 %	0 %	50 %	0 %	217322987
54	NC_011657	AAT	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217322987
55	NC_011657	A	7	7	1876	1882	100 %	0 %	0 %	0 %	217322987
56	NC_011657	GAA	2	6	2023	2028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011657	CAA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011657	GAAT	2	8	2182	2189	50 %	25 %	25 %	0 %	217322983
59	NC_011657	ATA	2	6	2205	2210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217322983
60	NC_011657	T	6	6	2278	2283	0 %	100 %	0 %	0 %	217322983
61	NC_011657	A	6	6	2301	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	217322983
62	NC_011657	TA	3	6	2319	2324	50 %	50 %	0 %	0 %	217322983
63	NC_011657	ACT	2	6	2347	2352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217322983
64	NC_011657	ACA	2	6	2385	2390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	217322983
65	NC_011657	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	217322985
66	NC_011657	TAA	2	6	2426	2431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	217322985
67	NC_011657	A	6	6	2513	2518	100 %	0 %	0 %	0 %	217322985
68	NC_011657	TA	3	6	2529	2534	50 %	50 %	0 %	0 %	217322985
69	NC_011657	T	6	6	2547	2552	0 %	100 %	0 %	0 %	217322985
70	NC_011657	GCTG	2	8	2584	2591	0 %	25 %	50 %	25 %	217322985
71	NC_011657	T	6	6	2793	2798	0 %	100 %	0 %	0 %	217322984
72	NC_011657	A	6	6	2812	2817	100 %	0 %	0 %	0 %	217322984
73	NC_011657	TAC	2	6	2818	2823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	217322984
74	NC_011657	A	8	8	2852	2859	100 %	0 %	0 %	0 %	217322984
75	NC_011657	A	6	6	2862	2867	100 %	0 %	0 %	0 %	217322984
76	NC_011657	AT	3	6	2870	2875	50 %	50 %	0 %	0 %	217322984
77	NC_011657	AT	3	6	2900	2905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011657	AT	3	6	2947	2952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011657	T	6	6	2983	2988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011657	T	6	6	3005	3010	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011657	T	8	8	3027	3034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.